經有記載，故而才有此一說。假如念誦者，純以佛珠作為記數的工具，則不必把母珠和隔珠計算在內，念誦時輕輕捻過便是。如是念誦的人，除了把佛珠當作精進、記數的工具外，還希望藉著它來體悟更多佛理的話，當手捏到隔珠的時候，可用“佛、法、僧”三寶，或“戒、定、慧”三學來觀想，當手掐到母珠的時候，也同樣可以觀想佛的相好光明，同時再逆時針朝相反方向捏念，即可解決此類問題了。

　　佛珠除了拿在手中起念誦記數的作用以外，還可以掛在頸部充當掛珠，或纏繞在手臂上起到佩珠的作用，這些都是具有深刻含義的：

　　　　　　二手持珠當心上，靜慮離念心專注，
　　　　　　本尊瑜伽心一境，皆得成就理事法。
　　　　　　設安頂髻或掛身，或安頸上及安臂，
　　　　　　所說言論成念誦，以此念誦凈三業。
　　　　　　由安頂髻凈無間，由帶頸上凈四重，
　　　　　　手持臂上除眾罪，能令行人速清凈。
　　　　　　若修真言陀羅尼，念諸如來菩薩名，
　　　　　　當獲無量勝功德，所求勝愿皆成就。

　　再者，密教中由于三部(胎藏界)、五部(金剛界)修法之不同，對于佛珠也有著特殊的要求，與平時常用的佛珠相比，是有所不同的。據《蘇悉地羯羅經》說：“佛部用菩提子珠，觀音部用蓮花子珠，金剛部用嚕椰羅叉子珠。”又據《守護經》及《瑜伽念珠經》說：“佛部用菩提子珠，金剛部用金剛子珠，寶部用金等諸寶珠，蓮花部用蓮花子珠，羯磨部用種種和合珠。”又近人金安一居士所著《密宗輯要》一文說：“修增法用琥珀珠，修息法用水晶珠，修壞法及長壽法用珊瑚珠，修誅法用人頭骨珠，修觀音法用菩提子珠，修一切法均可用鳳眼菩提子珠。”

　　另外，密教的經典對掐捻佛珠的指法也有詳細規定。從五部而言，《攝真實經》中記載：佛部以右手拇指與食指掐之，金剛部以右手拇指與中指，寶部以右手拇指與無名指，蓮花部以右手拇指與小指，羯磨部以右手拇指與其余四指合捻之。從三部而言，《蘇悉地經》中記載：佛部以右手拇指與其余四指的指尖相合，中指與小指直立，食指略屈附于中指中節以掐之；蓮花部以拇指與中指指尖相合，舒展其余三指而掐之；金剛部以拇指與食指指尖相合，舒展其余三指而掐之。