瑪瑙的保養，要注意不要碰撞硬物或是掉落，不使用時應收藏在質地柔軟的飾品盒內。要盡量避免與香水、化學劑液、肥皂或是人體汗水接觸，以防受到侵蝕，影響瑪瑙的鮮艷度。要注意避開熱源，如陽光、爐灶等，因為瑪瑙遇熱會膨脹，分子體積增大影響玉質，持續接觸高溫，還會導致瑪瑙發生爆裂。另外，瑪瑙要保持適宜的濕度，尤其是水膽瑪瑙在形成時期里面就存有天然水，如果當前周圍環境很干燥，就會引起里面天然水分的蒸發，從而失去其收藏的藝術和經濟價值。